По данным следствия, в 2016 году Сергей Ковригин получил взятку 52 тыс. рублей за передачу «Чебаркульского предприятия водоснабжения» (ЧПВ) и «Чебаркульского предприятия канализаций» (ЧПК) в аренду МУП «Теплоком».
Решением Арбитражного суда Челябинской области по иску прокурора области в 2017 году договоры аренды по передаче указанного муниципального имущества признаны недействительными, ничтожными.
Сергею Ковригину предъявлено обвинение в совершении преступлений, предусмотренных ч.2 ст.285 УК РФ «Злоупотребление должностными полномочиями», ч.2 ст.286 УК РФ «Превышение должностных полномочий», ч.4 ст.290 УК РФ «Получение взятки».
Расследование уголовного дела находится в завершающей стадии.
С 5 марта 2019 года Сергей Ковригин находится под домашним арестом.